Vous souhaitez contribuer à l'efficacité de nos outils et développements Bioinformatiques ? Rejoignez-nous !

Au sein de notre Division Grandes Cultures, dans une structure internationale, notre organisation dédiée aux Traits et aux Technologies élargit ses efforts de recherche.

Nous recherchons en CDI, au sein de notre Centre de Recherches de Chappes (à 20km de Clermont-Ferrand), notre futur(e) Bioinformaticien(ne) pour rejoindre la plateforme Biostatistiques & Bioinformatique et nous aider à mettre en place des pipelines bioinformatiques et maintenir notre cyberinfrastructure.

L'équipe de Bioinformatique fournit des méthodes et des outils pour organiser, structurer et exploiter les données génomiques afin de soutenir les applications de sélection et les efforts de découverte de gènes. L'équipe contribue également au développement de nouvelles technologies de génération de données en laboratoire. Cette activité est essentielle pour le pipeline de découverte de traits et en aval pour les activités d'édition de gènes ainsi que pour l'efficacité de nos efforts de sélection.

Vos principales missions consisteront donc à : 

- Contribuer au développement et à la maintenance de nos besoins en cyberinfrastructure, y compris notre plateforme Galaxy.

 - Aider à l'intégration de nouveaux outils et pipelines Bioinformatiques visant à faciliter la découverte scientifique grâce à la génomique.

 - Contribuer à la formation et au soutien des différentes équipes de recherche sur l'utilisation des outils/pipelines Bioinformatiques.

Le poste est rattaché au Chef d'équipe Bioinformatique au sein de notre centre de recherche de Chappes (63), qui regroupe différentes équipes de sélection et de support à la sélection.

Titulaire d'un Bac +5, Master II en Bioinformatique/ Biologie Computationnelle/ Génomique ou autre diplôme équivalent, vous avez l'habitude d’implémenter des pipelines et des outils bioinformatiques répondant aux besoins de recherche, notamment sur Galaxy.

Vous maîtrisez le travail dans un environnement Linux ou Unix et êtes à l'aise avec l'utilisation du HPC et des files d'attente (par exemple, Slurm, LSF ou équivalent). 

Vous avez une solide maîtrise de la programmation en Python, Perl ou un langage similaire adapté à l’analyse de données. Une expérience avec GIT et NetFlow serait un plus.

Rigoureux, sérieux, organisé, vous avez envie de relever de nouveaux défis en intégrant une équipe reconnue à l'international. Doté d'un fort esprit d'équipe, vous possédez d'excellentes compétences en communication et en relations interpersonnelles, à l'oral ou à l'écrit.

Vous maîtrisez l'anglais technique et scientifique tant à l'oral qu'à l'écrit. Parler le français serait un plus.

Ce poste en CDI est à pourvoir dès que possible au sein de notre Centre de Recherches de Chappes, à 20kms de Clermont-Ferrand (Auvergne, France).